一项关于婴儿喂养方式和儿童慢性疾病之间关系的调查显示，人工婴儿喂养同A型糖尿病、腹腔疾病、某些儿童癌症和肠道炎症有关。

腹腔疾病可能是当婴儿接触到含有面筋蛋白食物时发生自动免疫反应引起的。Ivarsson和她的研究小组对患有腹腔疾病的627名儿童和1254名健康儿童的喂养方式进行了研究，以确定在婴儿开始接触面筋食物期间的喂养方式对腹腔疾病的产生会有什么影响。

结果令人吃惊：母乳喂养的婴儿在两岁以前开始接触面食，患上腹腔疾病的风险会减少40%。研究人员还发现，如果在引入面食后仍继续用母乳喂养，那么这一效果就更加明显。

为了弄清婴儿早期喂养方式（例如，母乳喂养与非母乳喂养的不同影响、母乳喂养的时间长短、母乳喂养加面食的影响等等）对腹腔疾病的影响，研究人员翻阅了有关母乳喂养和腹腔疾病的文字资料。他们发现，患有腹腔疾病的婴儿其母乳喂养时间要短得多。在引入面食时仍继续母乳喂养的儿童患腹腔疾病的可能性比引入面食时停止了母乳喂养的儿童降低了52%。

研究人员提出了两种起到保护作用的潜在机制。第一，继续进行母乳喂养会限制面筋的吸收量。第二，母乳喂养会防止婴儿的肠胃感染。感染会增加婴儿内脏的渗透性，使面筋进入固有层。

炎症性肠病和克罗恩氏病（Crohn’s disease）这些慢性肠胃症状对用配方奶喂养的儿童来说更常见。研究人员在这方面做了17个分析项目，其结果支持这种假设，认为母乳喂养会降低患克罗恩氏病和溃疡性结肠炎的风险。

其他研究人员建议，母乳中的A型免疫球蛋白会降低免疫系统对吸收了的面筋做出反应，或者通过对个别淋巴细胞抑制的效果而调整免疫系统。